Эволюция живых существ может быть понята только в контексте геологического времени.
Некоторые бактерии способны размножаться в организме животных, вызывая в связи с этим болезни различной тяжести. Их вирулентность изменяется в зависимости от условий обитания и может быть понижена искусственно (приготовление вакцин). Иммунитет, возникающий после введения вакцины или естественного заражения микроорганизмами с пониженной вирулентностью, объясняется образованием антител, появляющихся в ответ на антиген вторгшегося патогенного микроба.
Инъекция сыворотки крови животного, перенесшего болезнь в легкой форме, также является средством предотвращения или лечения заболевания. Сущность этого метода состоит в действии антител сыворотки, которые разрушают или иммобилизуют соответствующие патогенные микроорганизмы. Специфическая агглютинация культур патогенных бактерий соответствующими антителами является способом идентификации патогенных микробов.
Некоторые обычно непатогенные бактерии в исключительных обстоятельствах могут стать таковыми при соответствующих условиях или в тех случаях, когда они случайно оказываются в кровеносной системе (например, Bacillus coli).
Патогенные микроорганизмы могут обитать в теле человека, не принося ему вреда, если человек обладает врожденным иммунитетом или если вирулентность микробного вида временно снижена, а также в тех случаях, когда специфическийгбактериальный штамм опасен только для какого-нибудь другого хозяина.
За исключением предприятий по производству удобрений стоки от населенных пунктов и промышленных комплексов содержат восстановленный азот в форме органических и аммонийных соединений. Бактериальная аммонификация в водных протоках протекает очень быстро, и уровень аммонийного азота хорошо коррелирует с органическими загрязнениями от сброса сточной воды.
Существует опасность нарушения состояния равновесия за счет азота, который таким образом вводится в природный круговорот. В аэробных условиях, например в речной воде, содержащей растворенный кислород, органические соединения и аммонийные соли превращаются в нитриты, а затем в нитраты. На это расходуется растворенный кислород. Такой процесс называется нитрификацией и протекает как две последовательные реакции.